集菌儀的日常維護及保養方法如下：

1. 定期清洗：定期清洗集菌器及配套管道，確保清洗干凈。
2. 定期檢查儀器：檢查集菌儀各接口是否緊密，防止漏氣。
3. 定期更換消耗品：定期更換過濾器、真空泵油等消耗品，確保其性能完好。
4. 防止污染：使用后集菌器應避免直接放置于桌面上，以免污染。
5. 保持干燥：集菌儀應放置于陰涼、干燥處，避免潮濕和污染。
6. 定期開機運行：定期開機運行集菌儀，以檢查其運行狀態和功能是否正常。
7. 維護保養：若長期不使用，應將儀器擦拭干凈后罩上防塵罩，定期給機械部位潤滑，以保證其性能。

在保養過程中，建議按照儀器說明書進行操作，并確保遵守所有相關的保養規定和安全規程。同時，如有任何異常或問題，應立即停止使用并及時聯系專業人員處理。